Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LIN52Q52LA3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LIN52Q52LA3 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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