Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms