Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms