Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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PTPROQ16827 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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PTPROQ16827 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
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PTPROQ16827 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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PTPROQ16827 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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PTPROQ16827 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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PTPROQ16827 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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