Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA2Q15822 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms