Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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UBE3CQ15386 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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UBE3CQ15386 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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UBE3CQ15386 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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UBE3CQ15386 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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UBE3CQ15386 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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UBE3CQ15386 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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UBE3CQ15386 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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UBE3CQ15386 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
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