Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TRIM25Q14258 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TRIM25Q14258 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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TRIM25Q14258 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TRIM25Q14258 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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TRIM25Q14258 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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