Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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DDX39BQ13838 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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DDX39BQ13838 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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DDX39BQ13838 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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DDX39BQ13838 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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DDX39BQ13838 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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DDX39BQ13838 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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DDX39BQ13838 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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DDX39BQ13838 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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