Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMC2Q13753 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms