Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms