Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGNL1Q0VF96 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms