Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms