Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC15Q0P6D6 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms