Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms