Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GABPAQ06546 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPAQ06546 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms