Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms