Protein–RNA interactions for Protein: Q00796

SORD, Sorbitol dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORDQ00796 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SORDQ00796 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SORDQ00796 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SORDQ00796 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SORDQ00796 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SORDQ00796 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SORDQ00796 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SORDQ00796 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SORDQ00796 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SORDQ00796 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SORDQ00796 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SORDQ00796 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SORDQ00796 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SORDQ00796 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SORDQ00796 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SORDQ00796 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SORDQ00796 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SORDQ00796 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SORDQ00796 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SORDQ00796 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SORDQ00796 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SORDQ00796 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SORDQ00796 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SORDQ00796 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
SORDQ00796 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SORDQ00796 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SORDQ00796 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SORDQ00796 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms