Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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CLDN15P56746 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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CLDN15P56746 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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CLDN15P56746 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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CLDN15P56746 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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CLDN15P56746 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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CLDN15P56746 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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CLDN15P56746 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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