Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GEMP55040 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GEMP55040 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEMP55040 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms