Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCT8P50990 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT8P50990 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms