Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCLMP48507 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GCLMP48507 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GCLMP48507 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GCLMP48507 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GCLMP48507 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLMP48507 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLMP48507 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms