Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRB2P47870 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms