Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP2P42575 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP2P42575 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP2P42575 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP2P42575 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP2P42575 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP2P42575 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP2P42575 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP2P42575 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASP2P42575 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CASP2P42575 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CASP2P42575 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CASP2P42575 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CASP2P42575 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASP2P42575 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASP2P42575 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP2P42575 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP2P42575 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms