Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 ADAM19-201ENST00000257527 6481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ARL3P36405 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ARL3P36405 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms