Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEFHP12036 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEFHP12036 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms