Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DMDP11532 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DMDP11532 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DMDP11532 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DMDP11532 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DMDP11532 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DMDP11532 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DMDP11532 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DMDP11532 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DMDP11532 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
DMDP11532 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DMDP11532 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DMDP11532 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DMDP11532 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DMDP11532 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DMDP11532 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DMDP11532 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DMDP11532 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DMDP11532 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DMDP11532 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DMDP11532 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DMDP11532 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DMDP11532 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DMDP11532 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DMDP11532 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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