Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
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PKHD1P08F94 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.91
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PKHD1P08F94 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
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PKHD1P08F94 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
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PKHD1P08F94 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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PKHD1P08F94 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PKHD1P08F94 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
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