Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSLP07711 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSLP07711 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSLP07711 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSLP07711 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSLP07711 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSLP07711 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSLP07711 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSLP07711 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSLP07711 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSLP07711 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSLP07711 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSLP07711 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSLP07711 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSLP07711 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSLP07711 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSLP07711 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSLP07711 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSLP07711 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms