Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC9O60706 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms