Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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