Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AL135999.1-201ENST00000555968 3243 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 IKBKE-203ENST00000581977 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 SLC8A3-207ENST00000528359 2840 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 SLC8A3-210ENST00000534137 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ZSCAN20-202ENST00000373413 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 LIMK2-202ENST00000333611 3462 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 PCSK1-202ENST00000508626 2234 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ERBB2-203ENST00000445658 3238 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ARMCX2-203ENST00000356824 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 TXNRD1-201ENST00000354940 4082 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AC091178.1-201ENST00000583447 2305 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 POM121L6P-201ENST00000441186 1826 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 GABBR1-201ENST00000355973 3506 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 THSD1-201ENST00000258613 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 TMPRSS3-201ENST00000291532 3193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 MCAM-201ENST00000264036 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms