Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms