Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VPS29Q9UBQ0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms