Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms