Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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