Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AC124944.3-201ENST00000607976 1304 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AL392185.1-201ENST00000419620 395 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PDZD9-201ENST00000424898 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms