Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF6Q9BYE7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms