Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTP6

ZBED2, Zinc finger BED domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED2Q9BTP6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms