Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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GFI1Q99684 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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GFI1Q99684 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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GFI1Q99684 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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