Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms