Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FBXO38Q6PIJ6 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms