Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED27Q6P2C8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms