Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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