Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms