Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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SP6Q3SY56 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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SP6Q3SY56 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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SP6Q3SY56 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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SP6Q3SY56 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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SP6Q3SY56 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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SP6Q3SY56 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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SP6Q3SY56 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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