Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AMPD2-203ENST00000358729 2838 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LILRB3-203ENST00000391750 2848 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SRRM5-201ENST00000417606 2381 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms