Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CA9Q16790 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CA9Q16790 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CA9Q16790 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CA9Q16790 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CA9Q16790 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CA9Q16790 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CA9Q16790 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CA9Q16790 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CA9Q16790 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CA9Q16790 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CA9Q16790 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CA9Q16790 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CA9Q16790 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CA9Q16790 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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