Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FXNQ16595 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FXNQ16595 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FXNQ16595 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FXNQ16595 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FXNQ16595 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FXNQ16595 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FXNQ16595 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FXNQ16595 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FXNQ16595 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FXNQ16595 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FXNQ16595 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FXNQ16595 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FXNQ16595 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FXNQ16595 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FXNQ16595 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FXNQ16595 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FXNQ16595 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FXNQ16595 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FXNQ16595 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FXNQ16595 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FXNQ16595 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms