Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIK4Q16099 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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GRIK4Q16099 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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GRIK4Q16099 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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GRIK4Q16099 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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GRIK4Q16099 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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GRIK4Q16099 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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GRIK4Q16099 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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