Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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SCN9AQ15858 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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SCN9AQ15858 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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SCN9AQ15858 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCN9AQ15858 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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